1971年4月改称县卫生学校，隶属县卫生战线革命委员会、县卫生局，1977年改属县人民医院，1980年又隶属县卫生局。1986年2月，经省高教局批准，升格为县卫生职工中等专业学校；1989年3月，经县委、县政府批准，升格为局级单位，隶属县卫生局；1992年6月至2002年12月改称县（市）卫生成人中等专业学校，仍隶属县（市）卫生局。2002年8月11日，南海市卫生成人中等专业学校搬往新址：桂城雷岗公园内（原少工委培训基地），20日正式使用。2003年5月南海区政府批复“南海市卫生成人中等专业学校”更名为“佛山市南海区卫生职业技术学校”（南府函〔2003〕69号）。2003年11月省教育厅网上公布了南海卫校为首批办学评估合格学校(粤教职【2003】103号)。2009年9月学校搬迁至西樵镇上金瓯（原樵岗中学旧址）扩大规模办学至今。2000年9月起首次与佛山职工医学院联办护理大专班，2002年秋季至今，先后与江西中医学院、中南大学湘雅医学院、赣南医学院、华中科技大学网络学院、广州医学院、广州中医药大学联合办学开展成人在职学历教育。

2011年划归南海区教育局管辖，属公办、区直职业学校。也是佛山市唯一一所卫生类中等职业学校。主要承担护理、药学和康复技术类人才培养。在校生约3000人。

2014年加挂“南海区第二职业技术学校”牌，实行两个牌子一套人马办学模式。计划2015年增设经贸商科类专业并开始招生。